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白凡,


T: +86-010-62756164
E: fbai@pku.edu.cn

北京大学综合科研楼生物医学前沿创新中心331室

个人简介

  白凡研究员,1981 年出生,2003 年本科毕业于北京大学物理系,2008 年获英国牛津大学生物物理博士学位,2008-2011 年间先后在牛津大学、日本大阪大学从事博士后研究工作。长期从事进行细菌鞭毛分子马达、细菌趋化性和蛋白质输出机制的研究,于《自然》、《科学》等世界著名学术刊物发表多篇高水平论文。2011 年全职回国后,白凡实验室致力于将先进的单细胞基因测序技术应用于重大医学疾病问题的研究。在世界范围第一个报道单个循环肿瘤细胞的全基因组测序结果(PNAS ,2013; Genome Research ,2017; CCR ,2019),获得广泛关注。通过使用微量细胞测序技术,深入研究了肝癌的各种肝内转移病灶,揭示出肝癌转移广泛的异质性(Gastroenterology ,2016; Cancer Cell ,2019)。结合单细菌荧光成像和高通量基因测序技术,深入探究了细菌耐药性产生的分子机制(Molecular Cell ,2016; Molecular Cell ,2019; 获得Nature 重点评述)。

  白凡实验室将综合利用单分子荧光显微成像技术、单细胞基因测序技术,研究与医学临床直接相关的前沿课题,包括:

  (1)单细胞基因测序技术应用于癌症病人外周血循环肿瘤细胞研究,探索癌症转移的分子生物学机制及无创癌症诊断、预后判断、疗效评价的临床方法;

  (2)大样本基因测序研究中国人群高发癌症的基因突变特征,发掘引起癌症表型转化、转移的关键驱动事件;

  (3)研究细菌行为、致病性,抗生素杀菌原理和细菌抗药、耐药的分子机制。

 

代表性论文

  1. Li R#, Du Y#, Chen Z#, Xu D#, Lin T#, Jin S, Wang G, Liu Z, Lu M, Chen X, Xu T*, Bai F*, Macroscopic somatic clonal expansion in morphologically normal human urothelium, Science 370 (2020), pp. 82-89.

  2. Du Y#, Li R#, Chen Z#, Wang X, Xu T*, Bai F*, Mutagenic factors and complex clonal relationship of multifocal urothelial cell carcinoma, European Urology 71 (2017), pp. 841–843.

  3. Jin S#, Li R#, Chen M#, Yu C#, Tang L#, …….., Mai H, Gewurz B, Zhao B, Young L, Zhong Q*, Bai F*, Zeng M*, Single-cell transcriptomic analysis defines the interplay between tumor cells, viral infection, and the microenvironment in nasopharyngeal carcinoma, Cell Research 30 (2020), pp. 950-965.

  4. Zhang J#, Wang X#, Xing X#, Xu Z#, ……., Zhang Y, Zumla A, Maeurer M, Bai F*, Wang F*, Single-cell landscape of immunological responses in patients with COVID-19, Nature Immunology 21 (2020), pp. 1107-1118.

  5. Huang B#, Chen Z#, Geng L#, Wang J#, Liang H#, ......, Gong S*, Bai F*, Yang M*, Zhang Y*, Mucosal profiling of pediatric-onset colitis and IBD reveals common pathogenics and therapeutic pathways, Cell 179 (2019), pp. 1160-1176.