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邓伍兰, 研究员

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T:
E: wdeng@pku.edu.cn

北京大学综合科研2号楼201室

个人简介

  北京大学生物医学前沿创新中心研究员,北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员,北大 - 清华生命科学联合中心研究员,北京大学博雅青年学者。

  2006 年本科毕业于北京大学生命科学学院,2012 年获美国宾夕法尼亚大学分子细胞生物学博士学位,2013 年至 2019 年先后在霍 华德修斯医学研究所的Janelia Research Campus 及加州大学伯克利分校从事博士后研究工作。曾获宾夕法尼亚大学 Gutmann 领袖奖、费城儿童医院杰出科研人员奖及美国血液学协会研究生最高奖 ASH Merit Award 等奖项。科研成果发表在 Cell, PNAS, Science, Blood等国际期刊上并被频繁引用。2019 年获得中组部“海外高层次人才青年项目”的支持,于 8 月回国入职北京大学。

  邓伍兰课题组利用单分子荧光成像和基因组学等研究手段,关注于细胞中参与基因调控事件的分子的时空动态,结合 DNA 序列特征、表观遗传学特性、染色质空间构象等多个维度对转录调控机理进行研究,以阐释发育及疾病发生过程中的基因转录调控和染色质调控的分   子机制。通过采用跨学科技术手段,取得了一系列突出成果:首次在内源基因座上精细操纵染色质空间构象以控制基因转录活性;开发了   基于 CRISPR 的基因组 DNA 原位荧光成像的新方法 CASFISH;将活细胞单分子追踪荧光成像技术运用于转录调控分子机制研究,揭示了先锋转录因子与染色质作用的单分子特性。

代表性论文

  1. ​Wang Z#, Wang B#, Niu D#, Yin C, Bi Y, Cattoglio C, Loh KM, Lavis LD, Ge H, Deng W*. Mesoscale chromatin confinement facilitates target search of pioneer transcription factors in live cells. Nature Structural & Molecular Biology. 2024 (Accepted).
  2. Han X, Xing L, Hong Y, ..., Yan J, Deng W, Shen X*. Nuclear RNA homeostasis promotes systems-level coordination of cell fate and senescence.Cell Stem Cell. 2024 May 2;31(5):694-716.e11.
  3. Z. Wang, and W. Deng#, Dynamic transcription regulation at the single-molecule level. Developmental Biology 482, 67–81(2022).
  4. W. Deng#, X. Shi, R. Tjian, T. E. E. Lionnet, and R. H. Singer#, CASFISH: CRISPR/Cas9-mediated in situ labeling of genomic loci in fixed cells. Proceedings of the National Academy of Sciences 112, 11870-11875 (2015).
  5. S. C. Knight, L. Xie, W. Deng, B. Guglielmi, L. B. Witkowsky, L. Bosanac, E. T. Zhang, M. E. Beheiry, J.-B. Masson, M. Dahan, and Z. Liu, Dynamics of CRISPR-Cas9 genome interrogation in living cells. Science 350, 823-827 (2015).
  6. W. Deng*, J. W. Rupon*, I. Krivega, L. Breda, I. Motta, K. S. Jahn, A. Reik, P. D. Gregory, S. Rivella, A. Dean, and G. A. Blobel, Reactivation of developmentally silenced globin genes by forced chromatin looping, Cell 158, 849-860 (2014).
  7. W. Deng, J. Lee, H. Wang, J. Miller, A. Reik, P. D. Gregory, A. Dean, and G. A. Blobel, Controlling long-range genomic interactions at a native locus by targeted tethering of a looping factor. Cell 149, 1233-1244 (2012).
  8. T. Tripic*, W. Deng*, Y. Cheng, Y. Zhang, C. R. Vakoc, G. D. Gregory, R. C. Hardison, G. A. Blobel, SCL and associated proteins distinguish active from repressive GATA transcription factor complexes. Blood 113, 2191–2201 (2009).