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邢栋, 研究员


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个人简介

      北京大学生物医学前沿创新中心主任助理、研究员北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员,北京大学博雅青年学者。邢栋博士2012年毕业于北京大学,获得生物化学与分子生物学博士学位,之后在哈佛大学接受博士后训练。2018年获得第十四批“国家海外高层次人才引进计划青年项目”。2019年起任北京大学生物医学前沿创新中心及北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员。在博士后研究期间,邢栋博士开发了多项单细胞基因组测序技术,并持有多项相关专利。其中,LIANTI技术首次实现了单细胞全基因组的线性扩增,使得在单细胞中对基因组变异检测的准确度 和灵敏度较之前有了大幅提高。Dip-C 技术利用高效率的单细胞染色体构象捕获技术,首次解析了二倍体人类细胞的全基因组三维结构。加入北京大学后,邢栋博士课题组致力于利用前沿的基因组学和生物信息 学手段在单细胞水平上探索高等生物基因组在三维空间中的结构和功能。主要关注点包括基因组变异的精确测量,基因组三维空间结构的动态变化,染色质开放区域的观测,核小体的定位以及蛋白质与 DNA 的相互作用的测定等方面。并以此为核心对基因组稳定性、基因表达调控和基因组的三维结构与功能等领 域的基本生物学问题展开深入研究。在此基础上同时深入探索与基因组异常相关的重大疾病的分子机理和潜在的治疗策略。

代表性论文

  1. Liu Z, Chen Y, Xia Q, Liu M, Xu H, Chi Y, Deng Y, Xing D*. Linking genome structures to functions by simultaneous single-cell Hi-C and RNA-seq.Science. 2023 Jun 9;380(6649):1070-1076.
  2. Xing, D.#, Tan, L#., Chang, CH, Li, H., Xie, X.S., 2021. Accurate SNV detection in single cells by transposon-based whole-genome amplification of complementary strands. Proceedings of the National Academy of Sciences, 118 (8).
  3. Tan, L., Ma, W., Wu, H., Zheng, Y., Xing, D., Chen, R., Li, X., Daley, N., Deisseroth, K. and Xie, X.S., 2021. Changes in genome architecture and transcriptional dynamics progress independently of sensory experience during post-natal brain development. Cell, 184 (3), 741-758.
  4. Tan, L.#, Xing, D.#, Daley, N., Xie X.S., 2019. Three-dimensional genome structures of single sensory neurons in mouse visual and olfactory systems. Nature Structural & Molecular Biology, 26(4), 297-307.