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汤富酬, 副主任

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E: tangfuchou@pku.edu.cn

北京市海淀区颐和园路5号北京大学综合科研2号楼206室

个人简介

  北京大学生物医学前沿创新中心研究员,北京未来基因诊断高精尖创新中心研究员、副主任,北大-清华生命科学联合中心研究员 , 国家杰出青年科学基金获得者。1998年本科毕业于北京大学生物学系,2003 年研究生毕业于北京大学生命科学学院,获博士学位。2004-2010 年在英国剑桥大学Gurdon 研究所从事博士后研究,2010年回国,主要从事人类生殖系发育以及肿瘤发生的单细胞功能基因组学研究。系统发展了单细胞高通量测序技术体系,开启了单细胞组学测序时代;深入揭示了人类生殖系细胞发育的一系列重要的表观遗传学调控机制,推动了人类殖系细胞表观遗传学领域的发展;系统开展了人类结直肠癌的表观遗传学研究,揭示了结直肠癌发生过程中DNA去甲基化的分子机制。在 Cell (2013, 2015, 2020), Nature (2014, 2016, 2018, 2019), Science (2016, 2018), Nature Methods (2023), Cell Research (2020,2021, 2022, 2023), National Science Review (2023), Cell Stem Cell (2014, 2017a,b,c, 2018, 2019),Nature Genetics (2018),Nature Cell Biology (2018a, b), Cancer Cell (2020), Cancer Discovery (2024) 等学术期刊上发表通讯(或共同通讯)作者文章 70 余篇。

  生殖系细胞(包括全能性的受精卵和早期卵裂期细胞、多能性的内细胞团细胞和上胚层细胞、单能性的原始生殖细胞、胚胎期生殖细 胞、卵泡发生过程中的雌性生殖细胞、精子发生过程中的雄性生殖细胞、成熟卵细胞、成熟精子)是多细胞生物代际传递遗传信息以维持 物种延续的关键类型细胞。在生殖系细胞中发生的所有表观遗传学变化都要在下一代的生殖系细胞中发生逆转(重编程)以恢复到跟上一 代一样的表观遗传状态,因而生殖系细胞拥有最复杂也最精密的表观遗传编程和重编程机制。对生殖系发育的深入研究对于理解人类物种 命运以及不孕不育相关疾病的临床诊断和治疗具有重大意义。本实验室主要围绕人类生殖系发育研究多种干细胞的自我更新和分化发育调 控的表观遗传调控机理,以及相关的生殖系发育的表观遗传编程和重编程机理。利用我们发展的单细胞功能基因组学高通量测序技术体系(单细胞转录组、基因组、DNA甲基化组、染色质状态组、基因组三维结构组、以及多组学测序等技术),基因编辑技术、哺乳动物胚胎显微操作技术、类器官培养技术、以及人类胚胎干细胞体外定向分化等技术在单细胞和单碱基的极限分辨率下深入研究人类生殖系细胞 发育以及肿瘤发生过程中基因表达网络的表观遗传学调控机理,并在此基础上深入探索生殖细胞发育异常相关的不孕不育、以及癌症等疾 病的诊断和治疗策略。

   

代表性论文

  1. Liu Z, Hu Y, Xie H, Chen K, Wen L, Fu W, Zhou X*, Tang Fuchou*. (2024). Single-cell chromatin accessibility analysis reveals the epigenetic basis and signature transcription factors for the molecular subtypes of colorectal cancers. Cancer Discovery. 14: 1082-1105
  2. Li W, Lu J, Lu P, Gao Y, Bai Y, Chen K, Su X, Li M, Liu J, Chen Y, Wen L, Tang Fuchou*. (2023). scNanoHi-C: a single-cell long-read concatemer sequencing method to reveal high-order chromatin structures within individual cells. Nature Methods. 20: 1493-1505
  3. Lin J, Xue X, Wang Y, Zhou Y, Wu J, Xie H, Liu M, Wen L, Tang Fuchou*. (2023). scNanoCOOL-seq: a long-read single-cell sequencing method for multi-omics profiling within individual cells. Cell Research. 33: 879-882
  4. Zhou Y, Bian S, Zhou X, ..., Fu W*, Tang Fuchou*. (2020). Single-Cell Multiomics Sequencing Reveals Prevalent Genomic Alterations in Tumor Stromal Cells of Human Colorectal Cancer. Cancer Cell. 38(6):818-828.e5
  5. Zhou F, Wang R, Yuan P, Ren Y, Mao Y, Li R, Lian Y, Li J, Wen L, Yan L, Qiao J*, Tang Fuchou*. (2019) Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human implantation. Nature. 572: 660-664
  6. Zhu P, Guo H, Ren Y, ..., Wen L, Yan L*, Qiao J*, Tang Fuchou*. (2018) Single-cell DNA methylome sequencing of human preimplantation embryos. Nature Genetics. 50: 12-19